基因表達缺失值的加權(quán)雙向回歸估計算法
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由于受實驗條件等客觀因素制約,實驗所得到的基因表達譜數(shù)據(jù)存在數(shù)據(jù)缺失的現(xiàn)象,不利于數(shù)據(jù)的后續(xù)使用。如何在不丟失數(shù)據(jù)信息、不影響數(shù)據(jù)整體使用的情況下,對實驗數(shù)據(jù)進行估計、填充已成為目前生物信息學(xué)研究的熱點。本文通過利用核加權(quán)函數(shù)提取與缺失值所在的行列具有最大相似性的行列信息,提出了基于雙向核加權(quán)回歸估計的算法。在回歸過程中同時考慮基因表達的空間相關(guān)性和時間相關(guān)性信息,使回歸算法使用的信息更加充分。通過與其他缺失值估計算法相比較,加權(quán)雙向回歸算法的估計結(jié)果較好。
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