超級計算機在藥物制造的應用，可實現(xiàn)原子運動模擬
據IT media網報道， 日本理化研究所18日宣布已開發(fā)出專用于模擬水分子和蛋白質等運動的計算機MDGRAPE-4A，每秒可實現(xiàn)大約1300萬億次（1.3 petaflops）計算。
MDGRAPE-4A實現(xiàn)了包括蛋白質，藥物和水分子在內的總共10萬個原子的運動模擬，理化研究所稱它“擴大了藥物制造的可能性”。
用超級計算機進行藥物制造的優(yōu)勢在于，不用實際合成藥物也能僅通過結構式研究蛋白質的相互作用和結構變化。
理化研究所研究團隊開發(fā)了專門用于計算原子之間作用力的算法和專用硬件，專用計算機采用了開放源代碼體系結構“ RISC-V”，“ MDGRAPE-4A是世界上第一個基于RISC-V的實用大規(guī)模系統(tǒng)”。
據悉，普通的超級計算機模擬10萬個原子在100微秒間的運動需要1年零三個月，而MDGRAPE-4A將這個期間縮短到了三個月。速度提升的原因除了超級計算機性能提升外，還因為MDGRAPE-4A將專用計算電路和通用計算合并到了SoC中，解決了在通用計算機中計算速度拖后腿的問題。
理化研究所稱，目前開發(fā)出統(tǒng)籌硬件和軟件共同解決分子動力學計算問題系統(tǒng)的只有美國的D.E.Shaw研究所和理化研究所，“今后也將繼續(xù)探究已有技術對人工智能的應用以及專用電路與通用電路相結合大型系統(tǒng)的研發(fā)”。
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發(fā)表于 03-19 09:59
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工商網監(jiān)
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