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DPU為高性能計(jì)算系統(tǒng)提供空前的創(chuàng)新空間

NVIDIA英偉達(dá)企業(yè)解決方案 ? 來(lái)源:NVIDIA英偉達(dá)企業(yè)解決方案 ? 作者:NVIDIA英偉達(dá)企業(yè)解 ? 2021-09-12 10:17 ? 次閱讀
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為了滿足更先進(jìn)的科研需求,全球各地的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)都在致力于重新設(shè)計(jì)代碼和算法。英國(guó)的面向 E 級(jí)計(jì)算算法和基礎(chǔ)設(shè)施優(yōu)化的 ExCALIBUR (the Exascale Computing ALgorithms and Infrastructures Benefiting UK Research) 項(xiàng)目就是這樣一個(gè)致力于為英國(guó)最重要的研究領(lǐng)域提供新一代高性能模擬軟件的科研項(xiàng)目。這些領(lǐng)域涉及到計(jì)算高度密集型的應(yīng)用,例如模擬整個(gè)宇宙的演變、了解地震波和引力波、評(píng)估海嘯以及對(duì)物質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)進(jìn)行建模等。

新型計(jì)算方案的出現(xiàn),包括智能且可編程的互連解決方案如 DPU(數(shù)據(jù)處理器)等,為研究人員在新的高性能計(jì)算系統(tǒng)上提供了空前的創(chuàng)新空間。NVIDIA BlueField DPU 集強(qiáng)大的網(wǎng)絡(luò)計(jì)算引擎、高速網(wǎng)絡(luò)和豐富的可編程性于一體,為最苛刻的應(yīng)用提供了軟件定義、硬件加速的解決方案。

擁有分布在劍橋大學(xué)、萊斯特大學(xué)、杜倫大學(xué)和愛(ài)丁堡大學(xué)這四所大學(xué)的計(jì)算資源的 DiRAC(Distributed Research utilising Advanced Computing)正在參與ExCALIBUR 項(xiàng)目,正在以全新的方式利用 BlueField DPU 豐富的可編程能力助力科學(xué)突破。

例如杜倫大學(xué)的計(jì)算宇宙學(xué)院和計(jì)算機(jī)科學(xué)系,他們正在對(duì)地震波和引力波的傳播進(jìn)行大規(guī)模模擬,該模擬使用動(dòng)態(tài)笛卡爾網(wǎng)格和 ExaHyPE 代碼將大部分的計(jì)算轉(zhuǎn)化為多任務(wù)操作。

在過(guò)去幾年中,他們付出了大量的精力來(lái)標(biāo)記和識(shí)別那些需要與其它網(wǎng)格發(fā)生變化的節(jié)點(diǎn)或任務(wù)同步的關(guān)鍵任務(wù)。由于存在大量的低優(yōu)先級(jí)任務(wù),保證整個(gè)系統(tǒng)的負(fù)載平衡的工作量將會(huì)很大。即使達(dá)到最佳負(fù)載平衡后,一旦域內(nèi)任何參數(shù)發(fā)生變化,系統(tǒng)立刻就會(huì)隨之變得不平衡,要想再次達(dá)到最佳負(fù)載平衡會(huì)非常困難并且會(huì)耗費(fèi)大量的時(shí)間或成本。

為了提升系統(tǒng)的應(yīng)變能力,研究人員必須將輕量任務(wù)和閑置任務(wù)轉(zhuǎn)移到其它資源上,但是,編排就會(huì)變得十分困難,同時(shí)通過(guò)調(diào)節(jié) MPI 運(yùn)行時(shí)來(lái)確保在正確的時(shí)間用正確的步長(zhǎng)來(lái)進(jìn)行計(jì)算,也會(huì)搶占計(jì)算資源。

憑借 BlueField DPU 計(jì)算核,杜倫大學(xué)可以使用 DPU 作為 MPI 處理引擎來(lái)節(jié)省計(jì)算資源,例如觀察和引導(dǎo)任務(wù),以及及時(shí)緩存/接受任務(wù)等。這項(xiàng)工作延伸了 ExaHyPE 組織內(nèi)部的研究合作,尤其是 TUM 的 Michael Bader 小組,對(duì)于以 CPU 核心的計(jì)算任務(wù)提出來(lái)一個(gè)全新的觀點(diǎn),即開始由智能網(wǎng)絡(luò)承擔(dān)起數(shù)據(jù)處理工作。

倫敦大學(xué)學(xué)院的研究生 James Legg 正在使用 BlueField DPU 通過(guò)使用基于任務(wù)的調(diào)度機(jī)制來(lái)加速計(jì)算代碼。James 的研究方向就是使用 BlueField DPU,尤其是其 Arm 處理器子系統(tǒng)來(lái)作為任務(wù)調(diào)度器,由主機(jī)處理器來(lái)運(yùn)行計(jì)算任務(wù)或內(nèi)核。這顛覆了傳統(tǒng)的加速卡運(yùn)行在內(nèi)核,由主機(jī)來(lái)管理所有任務(wù)的認(rèn)知。以前,當(dāng)調(diào)度器和內(nèi)核都在主機(jī)上運(yùn)行時(shí),它們會(huì)強(qiáng)奪處理器資源,使得調(diào)度器的設(shè)計(jì)必須簡(jiǎn)單。在 BlueField DPU 上,調(diào)度器可以輕松擁有幾個(gè)專用線程,實(shí)現(xiàn)了調(diào)度處理和與主機(jī)運(yùn)行內(nèi)核的并行化,并可以執(zhí)行更復(fù)雜的調(diào)度操作。另外一項(xiàng)研究是如何在主機(jī)處理器完全不參與的情況下,利用 BlueField DPU 上的調(diào)度器在任意主機(jī) RAM 之間移動(dòng)計(jì)算數(shù)據(jù)。

CSD3 (Cambridge Service for Data Driven Discovery)是英國(guó)國(guó)家研究云,同時(shí)也是世界上性能最強(qiáng)大的科研云原生超級(jí)計(jì)算機(jī)之一。CSD3 通過(guò) BlueField DPU 來(lái)卸載主機(jī)上的安全策略和存儲(chǔ)框架等基礎(chǔ)設(shè)施管理操作,同時(shí)提供了應(yīng)用的加速與隔離,以此實(shí)現(xiàn)了 I/O 性能的最大化。這既實(shí)現(xiàn)了安全性又得到了裸金屬性能,使研究人員能夠以全新的方式進(jìn)行研究。

以上只是研究人員如何利用 DPU 性能和可編程性來(lái)探索創(chuàng)新的一部分。為了進(jìn)一步簡(jiǎn)化編程,加速創(chuàng)新,NVIDIA 推出了 DOCA SDK,使基礎(chǔ)設(shè)施開發(fā)人員能夠使用行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的 API,在 BlueField DPU 上快速創(chuàng)建網(wǎng)絡(luò)、存儲(chǔ)、安全、管理以及 AI 和高性能計(jì)算(HPC)應(yīng)用和服務(wù)。憑借 DOCA,開發(fā)人員可以通過(guò)創(chuàng)建高性能、軟件定義和云原生的 DPU 加速服務(wù),對(duì)未來(lái)的超級(jí)計(jì)算基礎(chǔ)設(shè)施進(jìn)行編程?,F(xiàn)在,開發(fā)人員即可通過(guò)注冊(cè)提前體驗(yàn)。

責(zé)任編輯:haq

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原文標(biāo)題:DPU 助力英國(guó)高性能計(jì)算研究人員創(chuàng)新和改進(jìn)超算基礎(chǔ)設(shè)施

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