我們鼓勵您基于目前通用的產(chǎn)品部署生產(chǎn)解決方案，并考慮將新出現(xiàn)的解決方案納入下一代系統(tǒng)。 GPU Direct Storage 現(xiàn)已在 v1.0 版中全面提供，更多的供應(yīng)商合作伙伴正在將支持 GDS 的產(chǎn)品轉(zhuǎn)移到 GA 狀態(tài)。還有一系列案例研究，涵蓋存儲框架、深度學(xué)習(xí)、地震、數(shù)據(jù)分析和數(shù)據(jù)庫。

隨著 AI 、 ML 和 HPC 應(yīng)用程序的計算從 CPU 轉(zhuǎn)移到更快的 GPU ，輸入輸出 GPU 的 IO 可能成為整體應(yīng)用程序性能的主要瓶頸。

NVIDIA 創(chuàng)建了 Magnum IO GPU 直接存儲（ GDS ），以簡化存儲和 GPU 內(nèi)存之間的數(shù)據(jù)移動，并消除平臺中的性能瓶頸，例如被迫通過 CPU 內(nèi)存中的緩沖區(qū)存儲和轉(zhuǎn)發(fā)數(shù)據(jù)。

GDS 通過在本地 NVMe 存儲或 NIC 后面的遠程存儲和 GPU 內(nèi)存之間啟用直接內(nèi)存訪問（ DMA ），提高了帶寬，減少了延遲，減輕了 CPU 利用率的負(fù)擔(dān)。從 DGX 平臺上的 GDS 本身的深度學(xué)習(xí)推理、數(shù)據(jù)分析可視化和視頻分析中分別觀察到 2 。 5x 、 8x 和 9x 的性能優(yōu)勢。

要在部署的平臺范圍內(nèi)加速各種各樣的客戶應(yīng)用程序和框架，需要一系列合作關(guān)系。我們的目標(biāo)是實現(xiàn)整個豐富的數(shù)據(jù)存儲生態(tài)系統(tǒng)，該生態(tài)系統(tǒng)由近 180 家軟件和硬件供應(yīng)商以及 2500 多個貢獻者組成。有關(guān)更多信息，請參閱SNIA網(wǎng)站。

本文概述了 GDS 合作生態(tài)系統(tǒng)，并分享了我們合作伙伴的最新成果。

GDS 生態(tài)系統(tǒng)

NVIDIA 尋求一個開放的生態(tài)系統(tǒng)，與供應(yīng)商、框架開發(fā)人員和最終客戶建立越來越多的合作伙伴關(guān)系。自 GPU Direct Storage 的 1 。 0 產(chǎn)品發(fā)布以來，合作伙伴供應(yīng)商的生態(tài)系統(tǒng)已經(jīng)發(fā)展，如表 1 所示。

每個類別中的項目按時間順序排列。尚未發(fā)布的項目和正在開發(fā)的項目均為斜體。以黃色突出顯示的項目具有自本系列最后一篇 GDS 文章發(fā)布以來的新數(shù)據(jù)。

Vendor partnersFrameworks and applicationsSystems software

File systems

– DDN EXAScaler

– Weka FS

– VAST NFSoRDMA

– EXT4 via NVMe or NVMoF drivers from MLNX_OFED

– IBM Spectrum Scale （GPFS）

– DELL Technologies PowerScale

– NetApp/SFW/BeeGFS

– NetApp/NFS

– HPE Cray ClusterStor Lustre

Block systems

– Excelero

– ScaleFlux smart storageStorage

-HDF5

– ADIOS

– OMPIO

Deep learning

– PyTorch

– MXNet

Data analytics

– cuDF

– DALI

– Spark

– cuSIM/Clara

– NVTabular

Databases

– HeteroDB for PostgreSQL acceleration

Visualization

– IndeX– Ubuntu 18.04

– Ubuntu 20.04

– RHEL 8.3

– RHEL 8.4

– DGX BaseOS

Compatibility mode only：

– Debian 10

– RHEL7.9

– CentOS 7.9

– Ubuntu 18.04 （desktop）

– Ubuntu 20.04 （desktop）

– SLES 15.2

– OpenSUSE 15.2

Contributions to a repoSystems vendorsMedia vendors

Readers

– Serial HDF5

– IOR Containers

– PyTorch/DALI Samples

– Transparent threading

– Buffer agnostic– Dell

– Hitachi

– HPE

– IBM

– Liqid

– Pavilion– Kioxia

– Micron

– Samsung

– Western Digital

表 1 。 GPU 直接存儲生態(tài)系統(tǒng)中的產(chǎn)品

供應(yīng)商合作伙伴

我們有幾種不同類型的供應(yīng)商合作伙伴，他們的產(chǎn)品具有不同的成熟度。供應(yīng)商合作伙伴分為兩類：直接參與 GDS 軟件支持的合作伙伴和提供系統(tǒng)和組件解決方案的合作伙伴。

GDS 支持合作伙伴全面提供

本節(jié)涵蓋了那些積極地使英偉達 GPU 直接存儲到他們擁有的軟件棧中的合作伙伴，滿足 NVIDIA 基本功能和性能標(biāo)準(zhǔn)，并將其集成到一般可用性的生產(chǎn)解決方案中。

DDN 將 GDS 集成到基于 Lustre 的 EXAScaler 并行文件系統(tǒng)中。他們正在與社區(qū)合作，將 GDS 支持上游到開源發(fā)行版。

Dell Power Scale 是 NFS 的優(yōu)化實現(xiàn)。

IBM Spectrum Scale ，以前稱為 GPFS ，是 HPC 、數(shù)據(jù)和 AI 中廣泛使用的分布式并行文件系統(tǒng)。

龐大的并行分布式文件系統(tǒng)開創(chuàng)了通過 RDMA （ NFSoRDMA ）提供多路徑 NFS 的先河。 VAST 還使 nconnect 中 NFSoRDMA 中的 GDS 在將來的上游版本中可用。

Weka 將 GDS 集成到自己的 Weka FS 并行分布式文件系統(tǒng)中。

解決方案和組件提供商全面提供

一些供應(yīng)商對 GDS 的支持處于通用可用性級別。一些供應(yīng)商提供軟件解決方案，對代碼進行更改以啟用 GDS ，而其他供應(yīng)商則是已經(jīng)或?qū)⒁褂?GDS 的組件或系統(tǒng)供應(yīng)商。

提供硬件或 GDS 特性數(shù)據(jù)的供應(yīng)商

NVIDIA 與我們的 NPN 和 GPU 直接存儲合作伙伴密切合作，以鑒定 GDS 的全部功能。他們還使用硬件和軟件解決方案，結(jié)合 NVIDIA 帶來的最佳 GPU 加速技術(shù)，量化測量的性能增益。這些措施包括：。

使用其他支持 GDS 的解決方案（如 MLNX _ OFED 中提供的解決方案）提供完整端到端解決方案的系統(tǒng)供應(yīng)商合作伙伴包括：

數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)網(wǎng)

戴爾科技

惠普企業(yè)

國際商用機器公司

亭閣

巨大的

與我們合作最密切的組件供應(yīng)商包括：

基奧西亞

微米

桑孫

標(biāo)度通量

表達興趣的供應(yīng)商

對 GDS 表示強烈興趣的其他供應(yīng)商包括：

日立

輕盈

西部數(shù)字

開發(fā)中的 GDS 支持合作伙伴

有些合作伙伴的產(chǎn)品可供您評估，但尚未達到全面可用的成熟期：

BeeGFS 并行分布式文件系統(tǒng)是 HPC 中常用的文件系統(tǒng)。 System Fabric Works 一直在與 NetApp 合作為 BeeGFS 啟用 GDS 。

Excelero NVMesh 將任何網(wǎng)絡(luò)上的 NVMe 驅(qū)動器轉(zhuǎn)換為支持任何本地或分布式文件系統(tǒng)的企業(yè)級受保護共享存儲。

HPE 促成了 Cray ClusterStor E1000 Storage System中使用的支持 GDS 的 Lustre 并行分布式文件系統(tǒng)代碼的升級。

NetApp 目前正在致力于啟用服務(wù)器端 NFSoRDMA ，因此他們可以利用其他人在客戶端啟用 NFS 的 GDS 。

具有 GDS 的供應(yīng)商證明點

自 NVIDIA 發(fā)布last GDS post以來，已有幾項新數(shù)據(jù)的開發(fā)。我們在這篇文章中分享了其中的一個示例，作為證明 GPU 直接存儲的好處和通用性的證據(jù)。

配置

GDS 可以通過跳過各種平臺上的 CPU 跳出緩沖區(qū)來增加價值，無論是 NVIDIA 的 DGX 系統(tǒng)還是第三方 OEM 平臺。如前一篇文章Accelerating IO in the Modern Data Center： Magnum IO Storage所述，當(dāng) NIC PCIe 交換機 – GPU 數(shù)據(jù)路徑不經(jīng)過 CPU 就可用時， GDS 可用的理論峰值帶寬有 2 倍的差異，盡管實際增益可能要大得多。

在 DGX 中，某些 NIC 插槽的數(shù)據(jù)路徑必須經(jīng)過 CPU ，而對于其他插槽，直接 NIC PCIe 交換機 GPU 路徑可繞過 CPU 。圖 2 顯示了 DGX A100 背面的標(biāo)記圖片。

圖 2 。帶有標(biāo)記 NIC 插槽的 DGX A100 背面圖片。插槽 4 和 5 （傳統(tǒng)上連接到存儲網(wǎng)絡(luò)）分別連接到 CPU 。插槽 0-3 和 6-9 分別連接到 PCIe 交換機，與 GPU s 0-7 一樣。

有兩種配置可以在 DGX A100 上評估存儲性能。經(jīng)批準(zhǔn)的標(biāo)準(zhǔn)配置在插槽 4 和 5 中專用于連接到用戶管理平面和外部存儲平面的兩個“南北”（朝向數(shù)據(jù)中心邊緣） NIC ，以及在插槽 0-3 和 6-9 中專用于連接到節(jié)點間計算平面的八個“東西”（集群內(nèi)） NIC 。

我們正朝著使用八個東西方 NIC 訪問高帶寬存儲的方向發(fā)展，從而在完成 QoS 評估之前創(chuàng)建一個聚合計算存儲平面?，F(xiàn)在，我們稱之為實驗的配置

以前提供的合作伙伴數(shù)據(jù)

自從第一次發(fā)布 GDS 后， NVIDIA 已經(jīng)公開了其他供應(yīng)商的數(shù)據(jù)。其中包括來自 DDN EXAScaler 、 Pavilion NFSoRDMA 、 VAST NFSoRDMA 和 Weka FS 的數(shù)字。使用 DGX A100 上的實驗性 8-NIC 配置，我們已經(jīng)看到供應(yīng)商提供的帶寬范圍為 152 到 178 GiB （ 186 GB / s ）的 GDS 。如果沒有 GDS ，他們報告的帶寬范圍為 40-103 GiB / s 。

今后， NVIDIA 要求任何合作伙伴的 DGX 系統(tǒng)性能報告（包括 8-NIC 數(shù)據(jù)）也應(yīng)包括兩個南北 NIC 的特性描述。這些數(shù)據(jù)還沒有全部出來，所以這里沒有介紹。我們的政策是不在供應(yīng)商合作伙伴之間進行直接性能比較。

以太網(wǎng)上的海量數(shù)據(jù)

以前在 InfiniBand 上報告了海量數(shù)據(jù)通用存儲。他們提供了一個單一（插槽 4 ） NIC 和 DGX A100 中的 1 GPU 的新結(jié)果，該 DGX A100 具有龐大的入門級 1 × 1 配置，使用以太網(wǎng)而不是 InfiniBand 。以太網(wǎng)顯示了完整的功能和相當(dāng)?shù)男阅?。從單個鏈路實現(xiàn)超過 22 GiB / s 的速度接近最高性能。這表明，除了 InfiniBand 之外， GDS 同樣適用于以太網(wǎng)。

圖 3 。在 GDS v 上，插槽 4 中有 1 個 NIC ，插槽 1 GPU 中有 1 個 NIC ，以太網(wǎng)具有極高的讀取性能。 1 。 0 。 0 。 61 ， 96 個螺紋，預(yù)取開啟。帶寬優(yōu)勢高達 1 。 17 倍， CPU 利用率優(yōu)勢高達 6 。 4 倍。

IBM 頻譜規(guī)模

IBM Spectrum Scale （前身為 GPFS ）的 GA 產(chǎn)品最近有了一個條目。在他們的配置中，一個運行 IBM Spectrum Scale 5 。 1 。 1 的 ESS 3200 存儲文件服務(wù)器提供了 71 GiB / s （ 77 GB / s ）。它通過 4 個 HDR NIC 的 NIC 插槽 4 和 5 連接到兩個采用傳統(tǒng)存儲網(wǎng)絡(luò)配置的 DGX A100 。 IO 大小為 1MB 。通常情況下，絕對性能隨著使用的線程數(shù)的增加而提高（圖 4 ）。與沒有 GDS 的情況相比， GDS 的相對改進在線程數(shù)量方面仍然相當(dāng)穩(wěn)定，但在線程數(shù)量較少的情況下顯然是最好的。

圖 4 。 IBM Spectrum Scale 5 。 1 。 1 讀取性能，具有足夠（ 2 ）個 DGX A100 盒，可使單個 IBM ESS 3200 飽和。 GDS 收益超過 2 倍。

展館數(shù)據(jù)結(jié)果

Pavilion 為分布式并行文件系統(tǒng)、塊和對象接口提供存儲解決方案。它使用 NFSoRDMA 啟用 GDS 。 Pavilion Data 提供占用四個機架單元（ RU ）的存儲節(jié)點，提供足夠的帶寬，其中兩個節(jié)點可以使四個 DGX A100 上的兩個 NIC 或單個 DGX A100 上的八個 NIC 達到飽和。圖 5 中的結(jié)果僅來自實驗配置， Pavilion 軟件版本 2 執(zhí)行文件訪問。

圖 5 。 4RU Pavilion 存儲產(chǎn)品為 DGX A100 的一半提供高達 89 GiB / s 的 NFSoRDMA 讀取性能。 GDS 提供了 2 。 5 倍的帶寬和延遲優(yōu)勢，同時將 CPU 利用率（如下所示的延遲）降低了 1 。 7 倍用于讀取，更多用于寫入。在 8RU 中加倍到兩個 Pavilion 節(jié)點應(yīng)線性縮放。

Liqid 結(jié)果

最近在 Liqid 系統(tǒng)上測量的性能表明，基于 PCIe 的 P2P 路徑比基于以太網(wǎng)/ InfiniBand 的 NVMe 更快。 GPU 和與 GDS 集成的 SSD 之間的 P2P 通信達到 2900K IOPS ，吞吐量提高了 16 倍。與非 GDS 路徑相比，延遲從 712 us 提高了 1 。 86 倍至 112 us （圖 6 ）。

GPU 到 SSD 且禁用 P2P

吞吐量： 179K

IOPS 潛伏期： 712 us

GPU 到 SSD ，帶啟用 GDS 的 P2P

吞吐量： 2900K

IOPS 潛伏期： 112 us

收集了三種不同配置的數(shù)據(jù)：

配置 1 ： GPU – 到 NVMe 。使用 Liqid 結(jié)構(gòu)連接同一 PCIe 結(jié)構(gòu)上的所有設(shè)備。

配置# 2 ： GPU – 到 – CPU – 到 NVMe 。將 GPU 和 NVMe 驅(qū)動器直接連接到 CPU 主板。

配置# 3 ： GPU – 到的 NIC NVMe 。使用 GPU 到（ CX-5 ）的 NVMe 通過網(wǎng)絡(luò)訪問遠程 NVMe 。

以下是配置的詳細(xì)信息：

主板： AsROCK 機架 ROME8D-2T ，配備 AMD Epyc 7702p 、 512GB DDR4 2933

系統(tǒng)軟件： Ubuntu 服務(wù)器 20 。 04 。 2 ， NVIDIA 驅(qū)動程序版本 470 。 63 。 01 ， CUDA 11 。 4

Liqid QD4500 配備 Phison E16 800GB 、 Gen4 PCIe 、運行 Liqid v3 。 0 的 24 端口 Gen4 數(shù)據(jù)交換機（ Astek ）的 24 端口管理交換機（ TOR ）

NVIDIA A100 40GB ， PCIe Gen4 與 LQS4500 位于同一 PCIe 交換機上

BIOS 設(shè)置 ACS = Off ，在 Liqid 中啟用 P2P 。

圖 6 。 GPU 和 SSD （或 NVMe 驅(qū)動器）之間的點對點（ P2P ）通信通過 GPU 直接存儲實現(xiàn)了幾個數(shù)量級的 IOPS 改進.GPU Liqid Matrix 擴展機箱中的直接存儲支持 GPU 和 SSD 之間的直接 P2P 通信，實現(xiàn)了高達 1620% 的 IOPS 加速和 86% 的延遲改善。

InfiniBand 和以太網(wǎng)

雖然 Infiniband 在傳統(tǒng) HPC 系統(tǒng)中很受歡迎，但以太網(wǎng)在企業(yè)數(shù)據(jù)中心中有著廣泛的應(yīng)用。 GDS 在以太網(wǎng)和 IB 上無處不在。關(guān)鍵要求是底層系統(tǒng)和遠程文件管理器支持 RDMA 。這在 RoCE 中是可能的。

那么，兩者之間的比較如何呢？以下是初步調(diào)查的一些結(jié)果。對通過擴展網(wǎng)絡(luò)訪問存儲的全面分析不在本文討論范圍之內(nèi)，但對于那些希望就其網(wǎng)絡(luò)設(shè)計做出數(shù)據(jù)驅(qū)動決策的人來說，這是值得鼓勵的。

圖 7 。對于 HDR 200 上的 InfiniBand （ IB ）和 Ethernet （ EN ），在兩個 NIC 上實現(xiàn)了對 DDN AI400x 文件服務(wù)器的讀寫帶寬，該帶寬是 IO 大小的函數(shù)，并帶有單個中間交換機。

圖 7 顯示了在以下條件下帶寬隨 IO 大小變化的并排比較：

單個 PCIe 樹中的兩個 NIC 使用 InfiniBand 連接到一個 DDN AI400x 文件服務(wù)器

單個 PCIe 樹中的兩個 NIC 使用以太網(wǎng)連接到同一 DDN AI400x 文件服務(wù)器

如您所見， IB 和帶有 GDS 的以太網(wǎng)的性能相當(dāng)， GDS 顯然是建立在 GPU 直接 RDMA 之上的。 IB 比以太網(wǎng)具有高達 1 。 17 倍的性能優(yōu)勢，尤其是在性能最高且網(wǎng)絡(luò)速度差異最大的更大 IO 尺寸下。

社區(qū)光澤

不同的供應(yīng)商為 Lustre 的社區(qū)版本增加了自己的價值。但我們的一些客戶僅限于使用 OSS 社區(qū) Lustre 。他們還能在非專有解決方案中享受 GDS 的好處嗎？答案是肯定的！

與不使用 GDS 相比， GDS 的帶寬、延遲和 CPU 利用率增益都與其他啟用 GDS 的實現(xiàn)類似?？上螺d版本 2 。 15 的每個發(fā)行版本。今天就試試吧！

混搭

我們在 NVIDIA 有一個實驗集群，我們稱之為 ForMIO （用于 Magnum IO ），因為它用于評估和審查與 Magnum IO （ MIO ）相關(guān)的各種技術(shù)。 DDN 和 Pavilion 慷慨地讓我們使用他們的設(shè)備進行文件管理。媒體供應(yīng)商 Kioxia 、 Micron 和 Samsung 慷慨捐贈了驅(qū)動器來填充其中一些文件服務(wù)器。我們很興奮，因為這加快了對 DL 框架和使用 GDS 的客戶應(yīng)用程序的評估。

我們做了一些瘋狂的嘗試，結(jié)果成功了！我們使用兩個 HDR 200 NIC 將一個 DDN AI400x 與 InfiniBand 連接起來，一個 DDN AI400s 與兩個 HDR 200 NIC 的以太網(wǎng)連接起來，八個本地 NVME 與一個 DGX A100 連接起來。我們使用 GDSIO 性能評估工具對所有客戶進行了測試。

圖 8 中的早期和未調(diào)整的結(jié)果顯示，存儲帶寬可以跨這些應(yīng)用程序組合，以向應(yīng)用程序提供帶寬。雖然我們在實踐中不一定推薦這一點，但知道這是可能的還是很酷的。感謝 DDN 支持實現(xiàn)這一點。

在單個 DGX A100 上分別（紅色、藍色、黃色）和同時（綠色）測量帶有 InfiniBand 的一個 DDN AI400x （使用兩個 HDR 200 NIC ）、帶有以太網(wǎng)的一個 DDN AI400s （使用兩個 HDR 200 NIC ）和八個本地 NVME 的性能。單個組件堆疊在每對的左側(cè)。當(dāng)它們都同時運行時，綠色條顯示性能。

在 GDS 的情況下，性能完全匹配，因為 GPU 目標(biāo)被仔細(xì)選擇為無干擾。在 CPU 中使用跳出緩沖區(qū)的非 GDS 情況下，進出 CPU 的擁塞會抑制并發(fā)性能。這是一個巨大的不同。

圖 8 。通過 IB 在 2 個 NIC 上實現(xiàn)了對 DDN AI400x 的讀取帶寬，通過以太網(wǎng)在 2 個 NIC 上實現(xiàn)了對不同 DDN AI400x 的讀取帶寬，以及 8 個本地 NVME 的讀取帶寬。分別和同時測量。

關(guān)于作者

CJ Newburn 是 NVIDIA 計算軟件組的首席架構(gòu)師，他領(lǐng)導(dǎo) HPC 戰(zhàn)略和軟件產(chǎn)品路線圖，特別關(guān)注系統(tǒng)和規(guī)模編程模型。 CJ 是 Magnum IO 的架構(gòu)師和 GPU Direct Storage 的聯(lián)合架構(gòu)師，與能源部領(lǐng)導(dǎo) Summit Dev 系列產(chǎn)品，并領(lǐng)導(dǎo) HPC 容器咨詢委員會。在過去的 20 年里， CJ 為硬件和軟件技術(shù)做出了貢獻，擁有 100 多項專利。他是一個社區(qū)建設(shè)者，熱衷于將硬件和軟件平臺的核心功能從 HPC 擴展到 AI 、數(shù)據(jù)科學(xué)和可視化。在卡內(nèi)基梅隆大學(xué)獲得博士學(xué)位之前， CJ 曾在幾家初創(chuàng)公司工作過，致力于語音識別器和 VLIW 超級計算機。他很高興能為他媽媽使用的批量產(chǎn)品工作。

Kiran K. Modukuri 是 NVIDIA 的首席軟件工程師，負(fù)責(zé)加速 IO 管道。他是 GPU 直接存儲產(chǎn)品的聯(lián)合架構(gòu)師。在加入 NVIDIA 之前，他曾在 NetApp 擔(dān)任高級軟件工程師。他在亞利桑那大學(xué)獲得了計算機科學(xué)碩士學(xué)位。他在分布式文件系統(tǒng)和存儲技術(shù)方面擁有超過 15 年的經(jīng)驗。

審核編輯：郭婷