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多維圖像處理開發(fā)人員面臨的挑戰(zhàn)

新機器視覺 ? 來源:NVIDIA企業(yè)開發(fā)者社區(qū) ? 作者:NVIDIA企業(yè)開發(fā)者社 ? 2022-08-01 10:40 ? 次閱讀
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圖像數(shù)據(jù)通常可以通過兩個維度(行和列)來描述,可能還有一個額外維度用于紅色、綠色、藍色( RGB )。然而,有時需要進一步的維度,以便在特定應(yīng)用和領(lǐng)域中進行更準(zhǔn)確和詳細的圖像分析。例如,您可能希望研究三維( 3D )體積,測量兩個零件之間的距離或建模該三維體積隨時間的變化(第四維)。在這些情況下,你需要兩個以上的維度來理解你所看到的。多維圖像處理,或 n– 維度圖像處理,是從具有兩個或多個維度的圖像數(shù)據(jù)中分析、提取和增強有用信息的廣義術(shù)語。它對于醫(yī)學(xué)成像、遙感、材料科學(xué)和顯微鏡應(yīng)用特別有用和必要。這些應(yīng)用中的一些方法可能涉及來自比傳統(tǒng)灰度、 RGB 或紅、綠、藍、 alpha ( RGBA )圖像更多通道的數(shù)據(jù)。使用具有識別、過濾和分割功能的設(shè)備, N 維圖像處理可以幫助您學(xué)習(xí)并做出明智的決策。多維圖像處理為您提供了在科學(xué)應(yīng)用中執(zhí)行傳統(tǒng)二維濾波功能的靈活性。具體來說,在醫(yī)學(xué)成像中,計算機斷層掃描( CT )和磁共振成像( MRI )掃描需要多維圖像處理,以形成身體及其功能的圖像。例如,在醫(yī)學(xué)成像中使用多維圖像處理來檢測癌癥或估計腫瘤大小。

多維圖像處理開發(fā)人員面臨的挑戰(zhàn)

除了識別、獲取和存儲圖像數(shù)據(jù)本身之外,處理多維圖像數(shù)據(jù)也面臨著一系列挑戰(zhàn)。首先,多維圖像的大小比二維圖像大,并且通常具有高分辨率,因此將其加載到內(nèi)存并訪問它們非常耗時。其次,處理圖像數(shù)據(jù)的每個附加維度需要額外的時間和處理能力。分析更多維度擴大了考慮范圍。第三,計算機視覺和圖像處理算法需要更長的時間來分析每個附加維度,包括低級操作和基元。多維濾波器、梯度和直方圖的復(fù)雜性隨著每個附加維度的增加而增加。最后,當(dāng)操作數(shù)據(jù)時,多維圖像處理的數(shù)據(jù)集可視化由于考慮的額外維度和必須呈現(xiàn)的質(zhì)量而變得更加復(fù)雜。在生物醫(yī)學(xué)成像中,所需的細節(jié)水平可以在識別癌細胞和受損器官組織方面產(chǎn)生差異。

多維輸入/輸出

如果你是從事多維圖像處理的數(shù)據(jù)科學(xué)家或研究人員,你需要能夠高效加載和處理大型圖像文件的軟件。流行的多維文件格式包括:

NumPy 二進制格式(.npy )

標(biāo)簽圖像文件格式( TIFF )

TFRecord (.TFRecord )

關(guān)

上述格式的變體

因為每個像素都很重要,所以您必須使用所有可用的處理能力準(zhǔn)確地處理圖像數(shù)據(jù)。圖形處理單元( GPU )硬件為您提供了處理和平衡實時分析復(fù)雜多維圖像數(shù)據(jù)的工作量所需的處理能力和效率。

cuCIM

Compute Unified Device Architecture Clara IMage ( cuCIM )是一個開源、加速的計算機視覺和圖像處理軟件庫,它利用 GPU 的處理能力來解決開發(fā)人員處理多維圖像的需求和難點。數(shù)據(jù)科學(xué)家和研究人員需要快速、易于使用、可靠的軟件來應(yīng)對日益增加的工作量。雖然專門針對生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用進行了調(diào)整,但 cuCIM 可用于地理空間、材料和生命科學(xué)以及遙感用例。cuCIM 提供 200 多種計算機視覺和圖像處理功能,用于顏色轉(zhuǎn)換、曝光、特征提取、測量、分割、恢復(fù)和變換。cuCIM 是一款功能強大且快速的圖像處理軟件,只需對現(xiàn)有管道進行最小的更改。cuCIM 為您提供了增強的數(shù)字圖像處理能力,這些能力可以集成到現(xiàn)有的管道中:

人工智能醫(yī)學(xué)開放網(wǎng)絡(luò)( MONAI )

Numba

NumPy

PyTorch

TensorFlow

您可以使用 C ++ 或 Python 應(yīng)用程序編程接口( API )進行集成,該接口與 OpenSlide for I / O 和 scikit image 相匹配,以便在 Python 中進行處理。cuCIM Python 綁定提供了許多常用的計算機視覺和圖像處理功能,這些功能很容易集成并編譯到開發(fā)人員的工作流程中。使用 cuCIM 不需要學(xué)習(xí)新的接口或編程語言。在大多數(shù)情況下,只添加一行代碼用于將圖像傳輸?shù)?GPU 。cuCIM 編碼結(jié)構(gòu)幾乎與 CPU 使用的結(jié)構(gòu)相同,因此利用 GPU 支持的功能幾乎不需要更改。由于 cuCIM 還支持 GPUDirect Storage ( GDS ),因此您可以高效地將數(shù)據(jù)直接從存儲器傳輸和寫入 GPU ,而無需在主機( CPU )內(nèi)存中創(chuàng)建中間副本。這節(jié)省了輸入/輸出任務(wù)的時間。憑借其快速設(shè)置, cuCIM 提供了 GPU 加速的圖像處理和高效的 I / O 的優(yōu)勢,只需開發(fā)人員付出最小的努力,并且不需要低級別的計算統(tǒng)一設(shè)備架構(gòu)( CUDA )編程。

審核編輯:彭靜
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