中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所（簡(jiǎn)稱上海有機(jī)所）是集基礎(chǔ)研究、應(yīng)用研究和高技術(shù)創(chuàng)新研究為一體的綜合性化學(xué)研究機(jī)構(gòu)，是中國(guó)科學(xué)院首批成立的 15 個(gè)研究所之一。從開(kāi)展抗生素和高分子化學(xué)的研究起步，在以有機(jī)化學(xué)研究為中心的基礎(chǔ)研究、應(yīng)用研究與高新技術(shù)開(kāi)發(fā)、人才培養(yǎng)等方面均取得令人矚目的成就。

上海有機(jī)所立足基礎(chǔ)交叉前沿領(lǐng)域，堅(jiān)持重大科學(xué)問(wèn)題和國(guó)家重大需求導(dǎo)向，發(fā)揮有機(jī)合成化學(xué)的創(chuàng)造性，加強(qiáng)與生命科學(xué)、材料科學(xué)的交叉與融合；致力于推動(dòng)我國(guó)化學(xué)轉(zhuǎn)化方法學(xué)、化學(xué)生物學(xué)、有機(jī)新材料創(chuàng)制科學(xué)等重點(diǎn)學(xué)科領(lǐng)域的發(fā)展。

上海有機(jī)所冷凍電鏡大數(shù)據(jù)計(jì)算系統(tǒng)建設(shè)方案

為了上海有機(jī)所能夠完成高效、專業(yè)的科學(xué)研究，榮聯(lián)為上海有機(jī)所提供了全套的冷凍電鏡數(shù)據(jù)分析計(jì)算、存儲(chǔ)解決方案，主要應(yīng)用于冷凍電鏡的數(shù)據(jù)采集、預(yù)處理、分析處理、三維重構(gòu)、數(shù)據(jù)三維可視化等環(huán)節(jié)，部署自動(dòng)化數(shù)據(jù)處理流程。

通過(guò)部署冷凍電鏡大數(shù)據(jù)計(jì)算系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)計(jì)算功能、存儲(chǔ)功能、Linux 3D 桌面云功能、集群管理與多用戶作業(yè)隊(duì)列管理功能和用戶存儲(chǔ)配額管理功能，同時(shí)完成對(duì)集群管理軟件系統(tǒng)、電鏡數(shù)據(jù)處理流程相關(guān)軟件、自動(dòng)化電鏡數(shù)據(jù)采集與處理流程腳本等內(nèi)容的安裝調(diào)試。

服務(wù)器層面，采用CPU+GPU系統(tǒng)計(jì)算服務(wù)器，均使用國(guó)有自主品牌高性能機(jī)架式服務(wù)器，適用于AI云、生命科學(xué)、醫(yī)療等應(yīng)用場(chǎng)景；

存儲(chǔ)層面，采用完全分布式的、統(tǒng)一的存儲(chǔ)系統(tǒng)，提供便捷部署且可大規(guī)模擴(kuò)展的集群存儲(chǔ)平臺(tái)，基于集群技術(shù)、分布式文件系統(tǒng)，提供文件存儲(chǔ)服務(wù)，集群存儲(chǔ)系統(tǒng)可輕松擴(kuò)展到數(shù)PB容量；

采用3D 云桌面系統(tǒng)提供多用戶同時(shí)在線計(jì)算作業(yè)，通過(guò) Web Linux桌面進(jìn)行Relion/MotionCorr2/Pymol/Coot/CCP4等業(yè)務(wù)軟件的作業(yè)提交、作業(yè)監(jiān)控與數(shù)據(jù)管理，支持用戶通過(guò) Web Linux桌面實(shí)時(shí)處理3D性能加速的Linux桌面應(yīng)用；

計(jì)算、存儲(chǔ)設(shè)備配置Infiband接口，和原設(shè)備IB互聯(lián)，配置千兆交換機(jī)，作為管理網(wǎng)絡(luò)；

科學(xué)研究更加高效

通過(guò)冷凍電鏡大數(shù)據(jù)計(jì)算系統(tǒng)的建設(shè)，上海有機(jī)所具備了完全的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)分析能力，借助該系統(tǒng)打通下機(jī)數(shù)據(jù)采集、傳輸壁壘，直接接入和控制冷凍電鏡光學(xué)系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)從數(shù)據(jù)采集到二維和三維生物結(jié)構(gòu)的分析，使數(shù)據(jù)預(yù)處理、數(shù)據(jù)可視化更加高效。

著眼于各種規(guī)模的冷凍電鏡設(shè)施，針對(duì)多用戶場(chǎng)景下規(guī)?；睦鋬鲭婄R數(shù)據(jù)計(jì)算實(shí)踐中的痛點(diǎn)問(wèn)題，上海有機(jī)所冷凍電鏡大數(shù)據(jù)計(jì)算系統(tǒng)支持全自動(dòng)化的數(shù)據(jù)分析流程和實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)質(zhì)量信息反饋，具有完備的、可視化的數(shù)據(jù)管理以及計(jì)算歷史追蹤和統(tǒng)計(jì)分析能力。

目前，榮聯(lián)冷凍電鏡數(shù)據(jù)分析平臺(tái)解決方案主要應(yīng)用于生命科學(xué)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析工作線中，已成功服務(wù)于清華大學(xué)、水木未來(lái)等重點(diǎn)行業(yè)客戶，積累了豐富的行業(yè)經(jīng)驗(yàn)。

審核編輯：符乾江