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數字微流控+比色法環(huán)介導等溫擴增,實現多種疾病的現場可視化診斷

微流控 ? 來源:微流控 ? 2023-07-29 09:53 ? 次閱讀
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隨著全球傳染病的流行,核酸檢測技術如聚合酶鏈反應(PCR)和等溫擴增在各種疾病的快速診斷中發(fā)揮了重要作用。

通常情況下,樣品需要通過冷鏈運輸到配備良好的醫(yī)院或檢測中心進行檢測。傳統(tǒng)的檢測過程高度依賴專業(yè)技術人員進行人工操作,從樣品到結果的整個過程耗時較長,無法滿足快速現場檢測的需求,特別是在資源有限的地區(qū)。此外,樣品的運輸不僅增加了成本,在儲存和運輸條件不當的情況下還可能導致樣本失效,造成假陰性結果。因此,開發(fā)快速、簡單、低成本的現場檢測平臺具有重要意義。

近日,北京師范大學-香港浸會大學聯合國際學院(UIC)雷波教授團隊、暨南大學董鋮副教授與珠海市迪奇孚瑞生物科技有限公司合作開發(fā)了一種基于數字微流控(DMF)技術和環(huán)介導等溫擴增(LAMP)顯色反應的可視化檢測平臺。

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該平臺包含多個反應單元,可同時檢測多個樣本中的多個靶標基因,大大提高了檢測效率。此外,利用DMF強大的液滴操控能力,實現了自動化終點檢測,避免了傳統(tǒng)終點檢測方法中由于開蓋等人工操作引起的污染問題。該研究通過將高濃度的干燥染料應用于LAMP的顯色檢測,大大提高了小體積反應液滴(5 μl)的顯色程度,使得反應結果無需特定的光源條件,在環(huán)境光照下即可進行肉眼判讀。

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圖1 用DMF-LAMP方法進行對蝦疾病診斷:(a)樣品制備;(b)芯片上操作和LAMP反應;(c)DMF芯片的側視圖和控制系統(tǒng)的方塊圖;(d)中性紅的分子結構以及由陽性LAMP擴增引起的顏色轉變;(e)從樣品到結果的整個過程的時間軸

該平臺可以應用于水產病害檢測,快速、準確地檢測出對蝦的三種常見病原體:腸細胞隱孢子蟲(EHP)、傳染性皮下和造血組織壞死病毒(IHHNV)以及白斑綜合征病毒(WSSV),檢測限為101拷貝/μL DNA。在這項研究中,該團隊還對DMF-LAMP方法進行了特異性和真實樣品檢測能力的評估。特異性實驗結果表明,該方法在與大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、鼠傷寒沙門氏菌以及早期死亡綜合征(EMS)和對蝦血細胞虹彩病毒(SHIV)等水及水產品中常見病原體的交叉反應測試中均無非特異性擴增,表現出良好的特異性。在真實樣本檢測實驗中,分別用DMF-LAMP法和qPCR商業(yè)試劑盒對58個蝦樣本進行檢測,結果表明,DMF-LAMP方法與商業(yè)化的qPCR方法檢測結果高度一致,Kappa值在0.91至1之間,證明了該方法在實際應用中的可靠性和準確性。

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圖2 DMF 芯片設計與制造:ITO玻璃上涂有疏水表面作為頂板,覆有疏水涂層的PCB基板被用作底板。在芯片組裝之前,底板上裝載了LAMP試劑并進行了風干處理。這兩個板之間夾著一個0.6 mm的間隔層用于液滴傳輸和LAMP反應 該團隊還提出一種基于RGB的圖像處理方法,利用智能手機在不同室外光照下獲得結果圖像,并且通過RGB分析,提出了一種簡單的判讀方法,未來有望創(chuàng)建自定義的手機App,以實現大批量結果的快速自動化分析。

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圖3 基于RGB的圖像處理分析:(a)在DMF芯片上進行包含中性紅的LAMP反應,并使用智能手機捕捉圖像。手動選擇感興趣區(qū)域(ROI),并在ImageJ中測量ROI的平均RGB值;(b)根據在實驗室LED照明下捕捉的圖像提取RGB值,比較陰性反應(n = 120)和陽性反應(n = 120)的平均值;(c)由陰性和陽性反應RGB值計算得出的差值;(d)在不同照明條件下,繪制陰性(N-)和陽性(P-)結果的R/G比和B/G比的圖表

該成果以“A digital microfluidic platform coupled with colorimetric loop-mediated isothermal amplification for on-site visual diagnosis of multiple diseases”為題,發(fā)表在英國皇家化學會期刊Lab on a Chip上。

總體而言,該研究建立的DMF-LAMP平臺在臨床、生物醫(yī)學、食品安全和環(huán)境等領域具有廣泛應用前景,具有成本低、操作簡單,檢測效率高等優(yōu)勢。未來將進一步在該平臺上整合樣本處理如核酸提取等步驟,以實現“樣本進-結果出”的一體化檢測。

論文鏈接:
https://doi.org/10.1039/D2LC01156E

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原文標題:數字微流控+比色法環(huán)介導等溫擴增,實現多種疾病的現場可視化診斷

文章出處:【微信號:Micro-Fluidics,微信公眾號:微流控】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

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