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機(jī)器學(xué)習(xí)在預(yù)測(cè)藥物心臟毒性的所有主要形式中起著關(guān)鍵作用

倩倩 ? 來源:互聯(lián)網(wǎng)分析沙龍 ? 2020-07-03 10:53 ? 次閱讀
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機(jī)器學(xué)習(xí)在預(yù)測(cè)藥物心臟毒性的所有主要形式中起著關(guān)鍵作用,可能有助于減少后期臨床試驗(yàn)失敗。

一位研究作者布蘭卡·羅德里格斯(Blanca Rodriguez)表示,即,牛津大學(xué)和計(jì)算機(jī)醫(yī)學(xué)大學(xué)計(jì)算心血管科學(xué)小組的研究人員展示了他們的“機(jī)器學(xué)習(xí)算法如何從基因表達(dá)數(shù)據(jù)中識(shí)別出可能導(dǎo)致六種潛在形式的心臟不良后果的藥物”。 ,來自牛津大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)系。研究人員在《藥理學(xué)前沿》上發(fā)表了他們的發(fā)現(xiàn)。

研究證明了該算法在精選的轉(zhuǎn)錄和分子譜數(shù)據(jù)集上的預(yù)測(cè),包括1,131種藥物,35%具有已知心臟毒性的藥物和9,933個(gè)樣品。藥物心臟毒性的六種形式包括:心臟疾病的體征和癥狀,心律不齊,心力衰竭,冠狀動(dòng)脈疾病,心包疾病和心肌疾病。

研究人員收集了數(shù)據(jù),然后提出并實(shí)施了“使用嵌套堆疊方法”的分類器鏈,以根據(jù)其預(yù)測(cè)心臟毒性形式的風(fēng)險(xiǎn)對(duì)藥物進(jìn)行分類。在采用無用藥交叉驗(yàn)證策略的所有心臟毒性類型中,機(jī)器學(xué)習(xí)方法對(duì)291種藥物的平均AUC均達(dá)到0.80。

遺棄藥物交叉驗(yàn)證策略模型可以區(qū)分心臟毒性類型為AUC為0.70的安全藥物和不安全藥物,但是該模型對(duì)于某些特定的藥物作用和藥物類型更為準(zhǔn)確,包括“心包疾病,心臟疾病和研究人員寫道,它們分別是抗腫瘤藥,抗炎藥,心血管藥和中樞神經(jīng)系統(tǒng)藥的癥狀,心力衰竭和心肌病。”

該模型可以預(yù)測(cè)藥物的急性和慢性作用。

“利用轉(zhuǎn)錄和分子特征,使用擬議的分類器鏈模型,通過嵌套-堆疊-藥物交叉驗(yàn)證驗(yàn)證,可以相對(duì)較好地預(yù)測(cè)所有藥物誘導(dǎo)的心臟毒性研究形式,并考慮所有算法……”研究人員寫道。

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